Открыта крупнейшая сеть по расшифровке генома

Опубликовано Июл 6, 2012 в Естественные науки, Новости

Несколько научных центров Китая и США открыли между двумя странами мощнейшую линию обмена данными, которая уже продемонстрировала впечатляющую пропускную способность – до 10 Гб в секунду.

Новая сеть, связывающая научные учреждения США и Китая, может в течение одного дня передавать более 100 миллионов мегабайт — это 5400 с лишним дисков Blu-Ray.

Новая линия передачи данных облегчит облачные вычисления в области геномики. Эта наука уже совершила революцию в понимании принципов функционирования живых организмов. Однако стоимость секвенирования ДНК неуклонно снижается, и количество данных, полученных с помощью нового поколения технологий секвенирования, растет беспрецедентными темпами. Огромный объем данных стал главной проблемой важнейших исследований генома. Ни одна лаборатория не в состоянии самостоятельно справится, например, с задачей полной расшифровки человеческого генома или его сличением с множеством геномов других организмов. Поэтому мощные сети передачи данных необходимы для дальнейшего прогресса в этой области.

Новая линия уже используется в научной работе. Так, ученые из китайского научного центра BGI передали 24 гигабайта геномных данных в Университет Калифорнии менее чем за 30 секунд. Ранее файл такого размера по интернету передавался более 26 часов.

«Использование 10-гигабитного сетевого соединения является настоящим прорывом, сравнимым с заменой бумажных писем электронной почтой, — рассказывает директор Национального центра биотехнологической информации (NCBI) доктор Давей Лин. — Это позволит ученым, работающим в сфере геномики, общаться и передавать данные намного быстрее, что в свою очередь позволит быстрее продвигаться в этой важной для человечества области».

Геномика, как направление в науке, сформировалась недавно – пару десятилетий назад. Секвенирование ДНК стало возможным лишь с появлением современных вычислительных машин. Количество пар оснований у живых организмов огромно. У человека их около 3 млрд., у некоторых существ в десятки раз больше. В настоящее время полностью секвенированы геномы нескольких организмов, включая человека. Геномика направлена на сравнение генов разных организмов и определение их функций, что проливает свет на функционирование всего живого.

Источник: http://rnd.cnews.ru/natur_science/news/line/index_science.shtml?2012/07/06/495591